In totale, sono state selezionate 48 galline e 6 galli, oltre a 10 galli di scorta. La maturità sessuale si è verificata a 21 settimane di età e il ritmo di ovodeposizione è progressivamente aumentato da 1 a 23% nel periodo ottobre-dicembre 2023. I riproduttori sono stati organizzati in 6 gruppi familiari, come descritto in Tabella 1.1, a gennaio 2024 e sono stati allevati in recinti a terra seguendo le stesse modalità di gestione e di registrazione dati già descritte per l’anno 2023. I parametri descrittivi (media, min, max) dei caratteri morfologici di tipo quantitativo misurati in tutti i riproduttori sono riportati in Tabella 1.2. La curva di ovodeposizione registrata da gennaio a luglio è riportata in Figura 1.1; in generale, il numero totale di uova prodotte per gallina nello stesso periodo (188 giorni) è variato da un minimo di 45 pezzi nella famiglia 6 a un massimo di 87 pezzi nella famiglia G, evidenziando un netto aumento rispetto all’anno precedente. Il peso medio dell’uovo è stato 34,9 g, valore analogo all’anno precedente, con un range compreso fra 21 e 52 g. I risultati di incubazione artificiale sono riportati per linea familiare in Tabella 1.3.

La caratterizzazione morfologica dei singoli riproduttori ha evidenziato la presenza di caratteri qualitativi omogenei, corrispondenti a livrea dorata frumento, tarsi gialli, orecchione bianco, occhi gialli/arancio, cresta semplice rossa a 5-6 punte, ripiegata nella gallina; i valori medi relativi ai caratteri morfologici quantitativi sono riportati in Tabella 1.5.

I primi episodi di ovodeposizione si sono registrati nei mesi di novembre e dicembre 2023; tuttavia, l’ovodeposizione ha presentato un ritmo costante e crescente nel periodo gennaio-marzo e decrescente nel periodo aprile-giugno con variazioni in funzione della linea familiare. La curva di ovodeposizione generale (periodo gennaio-giugno) e quelle calcolate per linea familiare (periodo marzo-giugno) sono riportate in Figura 1.3. In generale, il numero totale di uova prodotte per gallina nello stesso periodo (98 giorni) è variato da un minimo di 11,8 pezzi nella famiglia 1 a un massimo di 26,3 pezzi nella famiglia 2. Il peso medio dell’uovo è stato 54,2 g, con un range compreso fra 40 e 65 g.

Un campione biologico (penne) è stato prelevato dai maschi (n=49) a circa 40 giorni di vita per la caratterizzazione genetica finalizzata alla individuazione dei galli di rimonta in base a indice di variabilità individuale e alla valutazione di un piano di accoppiamenti (vedi Azione 2 e Azione 4). Le galline riproduttrici di rimonta sono state selezionate in base alla parentela e alla numerosità dei capi disponibili per linea familiare; in totale, sono state selezionate 25 galline. La numerosità dei riproduttori selezionati per linea familiare per la stagione riproduttiva 2025 e il relativo IC sono riportati in Tabella 1.7. Inoltre, sono stati selezionati e mantenuti in allevamento 3 maschi di scorta per eventuale sostituzione in caso di decesso.

I gruppi familiari sono stati formati a dicembre 2024 e saranno mantenuti in allevamento per tutto il periodo riproduttivo da gennaio a luglio 2025 per il monitoraggio della performance di ovodeposizione e riproduzione.

A inizio marzo, sono stati organizzati i gruppi familiari, 1 gruppo costituito dalle 3 tacchine schiuse nel 2022 (TV) e 2 gruppi costituiti rispettivamente da 2 e 3 tacchine schiuse nel 2023 (TG). Si prevede di accoppiare le tacchine TV a rotazione con i 3 maschi coetanei (schiusi nel 2022) e le tacchini TG con maschi giovani coetanei scelti casualmente e cambiati ogni 3 settimane. La caratterizzazione morfologica di tutti i capi ha previsto la valutazione di caratteri qualitativi e quantitativi; i primi sono risultati omogenei e corrispondenti allo standard, che prevede livrea di colore bronzato argento reticolato, caruncole rosso-arancioni, iride scuro, becco chiaro con striature nerastre, tarsi rosati; i valori medi relativi ai caratteri quantitativi sono riportati in Tabella 1.9. Nel periodo gennaio-marzo, la curva di ovodeposizione delle tacchine TG è stata costantemente crescente, aumentando da 6% a 80%, mentre le tacchine TV hanno ripreso l’ovodeposizione solo nel mese di marzo con un valore medio settimanale pari a 26%. La curva di ovodeposizione generale registrata da gennaio a giugno e quelle per linea familiare registrate da marzo a giugno sono riportate in Figura 1.5. In totale, la produzione totale di uova per tacchina in 177 giorni di ovodeposizione è variata da un minimo di 21 uova in famiglia 1 a un massimo di 49 uova in famiglia 3. Il peso medio dell’uovo è stato 72,5 g con un range 58-93 g.

Razza Nero di Italia (NI) – Un gruppo (n=10) di tacchini di razza Nero di Italia (NI) è stato introdotto a luglio 2023 per la costituzione di una popolazione nucleo. I tacchini sono stati mantenuti in quarantena per lo svolgimento di controlli sanitari e sono stati inseriti in allevamento a settembre. Tutti i capi sono stati marcati, con marca metallica all’ala, sessati e allevati a terra a sessi separati in box esterni nel periodo settembre-dicembre e in ambiente chiuso controllato nei mesi successivi. Il peso vivo è stato registrato a 98, 126, 160, 190 e 220 giorni di vita; la curva di crescita di maschi (n=3) e femmine (n=7) è riportata in Figura 1.8. La maturità sessuale delle tacchine è stata registrata a 45 settimane di vita nel mese di aprile 2024.

A inizio marzo, sono stati organizzati 3 gruppi familiari distribuiti casualmente, ognuno costituito da 2-3 tacchine e 1 maschio che è stato sostituito ogni 3 settimane. La caratterizzazione morfologica di tutti i capi ha previsto la valutazione di caratteri qualitativi e quantitativi; i primi sono risultati omogenei e corrispondenti allo standard, che prevede livrea di colore nero, caruncole rosse, iride scuro, becco scuro, tarsi dal rosso scuro al viola; i valori medi relativi ai caratteri quantitativi sono riportati in Tabella 1.12. La gestione dei riproduttori NI e la registrazione dei dati riproduttivi è stata analoga a quella già descritta per la razza BR. Si riportano in sintesi i risultati di ovodeposizione in Figura 1.9 e di incubazione artificiale in Tabella 1.13. In totale, la produzione totale di uova per tacchina in 177 giorni di ovodeposizione è variata da un minimo di 18 uova in famiglia 1 a un massimo di 31 uova in famiglia 2. Il peso medio dell’uovo è stato 78.2 g con un range 65-92 g. In totale, sono state incubate 84 uova e sono schiusi 30 tacchinotti. La fertilità e la mortalità embrionale sono state molto variabili tra gruppo familiare e, di conseguenza, anche la schiusa dei tacchinotti.

I risultati di analisi lipidica dei gameti maschili sono stati associati ai dati di valutazione qualitativa del seme (prodotti nel primo e secondo anno del progetto) evidenziando che le razze Robusta maculata e Bionda piemontese, oltre a differenziarsi rispettivamente come la migliore e la peggiore in relazione ai parametri di cinetica spermatica, si differenziano anche in relazione al profilo lipidico. I risultati di questo studio saranno presentati al prossimo convegno internazionale dell’Associazione Scientifica di Produzione Animale (ASPA), che si svolgerà nel 2025 a Torino.

Produzione e qualità di materiale seminale – Nel 2024, sono stati allevati galli adulti di razza Modenese (MO, n=7) e tacchini adulti di razza Brianzolo (BR, n=11) e Nero di Italia (NI, n=3), gli stessi utilizzati per la selezione dei gruppi familiari in riproduzione (vedi Task 1.2 e 1.3). Tutti i capi sono stati mantenuti in ambiente chiuso controllato e sono stati sottoposti a valutazione morfologica (vedi task 1.2, 1.3). Dopo un periodo di addestramento di alcune settimane, tutti i capi sono stati sottoposti regolarmente a due prelievi di seme settimanali nel periodo gennaio-marzo. La capacità di adattamento al prelievo manuale di seme è stata variabile in funzione dell’individuo e della razza; maschi donatori di seme sono stati individuati nelle razze MO e BR, mentre sono stati assenti nella razza NI. I valori medi dei parametri quanti-qualitativi misurati nei singoli eiaculati di razza MO e BR sono riportati in Tabella 1.19.

Caratterizzazione delle razze:

• Caratterizzazione morfologica secondo le linee guida FAO (2012) per l’aggiornamento e la validazione di quanto raccolto durante il primo progetto TuBAvI per le razze Mugellese (Mannelli et al., 2023) e Valdarnese bianca (manoscritto in fase di scrittura; Fig. 1.1) e prima caratterizzazione della razza Valdarno (dati in elaborazione);
• Accrescimenti ponderali (per la razza Mugellese riportati in Mannelli et al., 2023 e per la razza Valdarnese bianca riportati in Fig. 1.2), consumo di alimento e calcolo dell’indice di conversione alimentare per gli animali in accrescimento delle 3 razze in tutela presso il PA UniFI (per la razza Mugellese riportati in Mannelli et al., 2023; per la razza Valdarnese bianca e Valdarno i dati sono in corso di validazione o elaborazione) e valutazione del consumo di alimento in riferimento alla produzione delle uova nelle famiglie formate a seguito del cronoprogramma per i piani di accoppiamento (in fase di raccolta dati per le 3 razze);
• Produzione giornaliera delle uova (per la razza Mugellese dati riportati in Mannelli et al., 2023; per la razza Valdarnese bianca dati riportati in Fig, 1.3; per la razza Valdarno dati in fase di raccolta a seguito dei piani di accoppiamento).

I dati morfologici, di crescita e di deposizione, riportati per la razza Mugellese e pubblicati in Mannelli et al., 2023 sono in corso di validazione tramite ulteriori raccolte dati e, al fine di considerare le due livree selvatico oro e dorata frumento come due popolazioni distinte, sono state separate le famiglie appartenenti alle 2 livree standard.

Caratterizzazione fenotipica delle razze e delle specie autoctone Nel corso del terzo anno di attività si è proceduto al campionamento di materiale biologico (sangue) e alla registrazione delle caratteristiche fenotipiche degli animali appartenenti a:

• Razza Collo Nudo Italiana (specie: Gallus gallus) (n = 48)
• Razza Oca Padovana (specie: Anser anser) (n = 53)

La raccolta di tali informazioni ha portato al completamento dell’attività di registrazione delle misure morfometriche e di prelievo del materiale biologico (sangue) previste dal progetto TuBAvI-2.

La Tabella 1 riassume le caratteristiche fenotipiche qualitative (colore dei tarsi e della pelle) di tutte le specie/razze coinvolte nel progetto, mentre la Figura 1 riporta le statistiche descrittive (media e deviazione standard) delle caratteristiche fenotipiche quantitative (peso vivo, lunghezza del corpo, lunghezza dei tarsi, circonferenza dei tarsi, apertura alare, circonferenza dello sterno) rilevate sulle medesime specie/razze. Le caratteristiche fenotipiche sono presentate per maschi e femmine entro razza, e seguono le indicazioni fornite da FAO (Phenotypic characterization of animal genetic resources. FAO Animal Production and Health Guidelines, 2012).

La prova sperimentale per la caratterizzazione della razza Ancona è stata completata. In particolare, i rilievi comportamentali sono stati svolti durante i mesi di giugno e luglio 2023, durante le registrazioni venivano annotate le temperature minime e massime della giornata.
La prova, come per la precedente razza, ha prodotto un totale di 12 h di registrazione all’aperto e 12 h di registrazione al chiuso effettuate mediante il software Noldus XT.
La prova è stata svolta utilizzando gli stessi dispositivi, strutture e modalità utilizzate per la caratterizzazione della razza Livorno. Per questo motivo, si è proceduto all’applicazione di dispositivi individuali (pettorine) ai singoli animali, ogni parchetto esterno e box interno presentava Ancore UWB posizionate agli antipodi, 1 Tag UWB posizionato al centro, 1 Gateway UWB, 1 Computer per la raccolta dei file raw e 10 chip posizionati sulle pettorine (Figura 1).
Il software è riuscito a produrre per ciascun animale un report raw con una registrazione puntuale del comportamento ogni 2 secondi, rilevando la sua posizione spaziale all’interno dei quattro quadranti dell’area e dell’asse cartesiano (x, y, z), indicando la beccata e la distanza percorsa (Figura 2).

Caratterizzazione fenotipica di un nucleo di conservazione di razza Siciliana Nell’ambito del presente task, 28 riproduttori di razza Siciliana sono stati allevati presso l’azienda molisana in convenzione. I capi sono stati organizzati in 2 famiglie ed allevati all’aperto con l’accesso a ricoveri notturni, seguendo linee guida standard per l’allevamento avicolo.
Sono state svolte 2 incubazioni di uova per verificare il livello di fertilità e schiudibilità; i risultati registrati sono riportati in tabella 1.1.

Caratterizzazione fenotipica della razza di pollo Collo nudo italiana Nella proposta progettuale presentata, era previsto il mantenimento della razza Bianca di Saluzzo. Successivamente, di comune accordo con gli altri PA, questa razza è stata sostituita con la razza Collo nudo italiana, poiché non vi era ancora un nucleo di conservazione di questa razza. Ad ottobre 2023 la richiesta di sostituzione della razza è stata accolta dal Ministero, e sono state così avviate le attività per l’allevamento di un gruppo di polli di razza Collo nudo italiana. Tutti i soggetti (n = 40) sono stati allevati all’aperto presso l’azienda agricola pugliese in convenzione. Sono in corso le attività per la valutazione delle performance di ovodeposizione e riproduzione dei seguenti parametri zootecnici: ovodeposizione giornaliera, peso uovo fertilità e schiusa. Sui soggetti adulti disponibili sono state eseguite le misurazioni morfometriche, i dati ottenuti sono illustrati nella tabella 1.6.
Nel corso del 2024 è stata condotta una prova preliminare di incubazione artificiale su 26 uova, con un tasso di fertilità registrato dell’84,6% e un tasso di schiusa del 76,9%.
Su tutti i soggetti, sia maschi che femmine, è stato monitorato mensilmente il peso corporeo individuale. Nella tabella 1.7 sono riportati i valori medi del peso, espressi come media ± deviazione standard, rilevati dal primo giorno di vita fino ai 180 giorni di età.

Caratterizzazione fenotipica per la valutazione delle caratteristiche del seme fresco La qualità del materiale seminale è stata valutata nelle seguenti razze di tacchino: RO ed ER. I caratteri quali-quantitativi considerati sono stati i seguenti: volume, concentrazione spermatica, integrità di membrana cellulare (mediante citofluorimetro), motilità totale, progressiva e parametri cinetici (metodo CASA con software SCA). Nella tabella 1.10 sono riportati i risultati relativi alla qualità del seme fresco delle razze autoctone di tacchino considerate.

Sugli spermatozoi dei galli di razza SI sono state condotte le analisi del profilo lipidico, per l’estrazione dei lipidi totali è stato utilizzato il metodo di Folch, mediante l’impiego di un kit commerciale (Fatty Acid Extraction Kit, Low Standard – Sigma Aldrich). I lipidi totali sono stati separati nelle classi di lipidi neutri attraverso cromatografia su strato sottile. Le classi fosfolipidi totali, trigliceridi, acidi grassi liberi ed esteri del colesterolo sono stati sottoposti a trans-metilazione in reflux, seguita dalla determinazione della composizione degli acidi grassi tramite gascromatografia. I FAME sono stati separati mediante colonna capillare (Zebron ZB-FAME 30 m × 0.25 mm × 20 µm). Gli acidi grassi dei campioni sono stati comparati con i tempi di ritenzione dei picchi dello standard 37 FAME (Supelco). I risultati ottenuti sono riportati nella tabella 1.11.

Caratterizzazione fenotipica di polli di razza Livorno, Siciliana, Bianca di Saluzzo, Bionda Piemontese e Millefiori Piemontese Nel periodo considerato i riproduttori di pollo di razza Livorno (L) e Siciliana (S), nati nell’Aprile 2021 e allevati presso l’Allevamento Avicolo del Dipartimento di Scienze Veterinaria dell’Università di Pisa, hanno completato il secondo ciclo di deposizione nell’Ottobre-Novembre 2023. Tutti i capi sono stati allevati a terra su terreno sabbioso in recinzioni all’aperto con parziale tetto di copertura e sotto condizioni naturali di luce e temperatura.

Il monitoraggio della produzione giornaliera delle uova in seconda deposizione è proseguito fino al termine del ciclo (figura 1.1.1);, la valutazione ponderale delle stesse, nei 5 mesi centrali della stagione riproduttiva, è riportata nella figura 1.1.2 e l’indice di forma (Shape Index) scaturito dal rilevamento morfometrico delle uova è risultato pari a 74,1 e 68,9 rispettivamente per la razza Livorno e la Siciliana, evidenziando anche in seconda deposizione una forma dell’uovo decisamente diversa nelle due razze: ovale standard la prima e ovale affusolato la seconda . E’ stato completato a fine Giugno 2023 il rilievo del consumo di alimento dei soggetti in seconda deposizione e calcolato l’ICA uova (tabella 1.1.1). I soggetti per la rimonta nati ad aprile 2023 sono stati monitorati per la crescita, come previsto dal progetto (figure 1.1.3 e 1.1.4.).

I dati relativi alle razze piemontesi Bianca di Saluzzo (BS), Bionda Piemontese (BP) e Millefiori Piemontese (MP) conservate presso il Centro Avicolo per la Conservazione di Risorse Genetiche Locali (Carmagnola, TO – responsabile Prof. Achille Schiavone) sono raccolti e messi a disposizione a seguito del contratto di consulenza tecnica stipulato fra UniPI e UniTO dal 03/05/2022 (v. relazione tecnica del consulente UniTO).

All’inizio della prova, ovvero al 29° giorno di età, tutti gli animali sono stati sessati mediante esame visivo, pesati e marcati individualmente con un’etichetta alare. I pulcini selezionati sono stati trasferiti all’allevamento sperimentale e distribuiti in recinti differenti in base alla razza e al sesso (10 animali per recinto; 6 repliche/sesso per BP e BS e 4 repliche/sesso per MP), per un totale di 128 BP (64 maschi e 64 femmine), 128 BS (64 maschi e 64 femmine) e 88 MP (44 maschi e 44 femmine) inclusi nello studio. Le dimensioni dei recinti erano di 6 m x 1.5 m x 10 m (lunghezza, larghezza, altezza) e come lettiera è stata utilizzata la lolla di riso. L’edificio è dotato di sistema di ventilazione naturale, quindi le condizioni climatiche erano paragonabili a quelle esterne. Le condizioni ambientali dal 29° al 182° giorno di età (da giugno a novembre 2023) sono riportate nella Figura 1.1. Durante la prova, gli animali sono stati alimentati ad libitum con un mangime commerciale per il primo periodo 1-28 giorni (AMEn: 12,5 MJ/kg e PG: 22,0%, su base tal quale), un mangime per il secondo periodo 29-88 giorni (AMEn: 12,8 MJ/kg e PG: 20,5% su base tal quale) e un mangime commerciale per il terzo periodo 85-182 giorni (AMEn: 13,3 MJ/kg e PG: 18,0% su base tal quale) (Fratelli Borello S.p.A., Bra, CN – Italia). L’acqua è stata fornita ad libitum per tutta la durata dello studio. Gli animali sono stati monitorati fino ai 182 giorni di età, dopodiché 15 maschi/razza sono stati selezionati per la valutazione delle performance di macellazione (Tabella 1.1).

Le Figure 1.6 e 1.7 rappresentano l’andamento dell’indice di conversione alimentare (ICA) delle tre razze piemontesi, rispettivamente per femmine e maschi. La rappresentazione grafica dimostra come MP abbia manifestato valori più favorevoli per entrambi i sessi. Nei periodi 155-169 e 169-181, per entrambi i sessi, si osserva un forte peggioramento per BS e BP, fatto che indica il forte rallentamento del ritmo di crescita di queste due razze oltre i 150 giorni di età, mentre MP presenta un pattern di crescita più prolungato e di conseguenza valori di ICA più favorevoli anche nella fase finale del periodo di osservazione.

La Tabella 1.1 rappresenta le performance di macellazione dei maschi delle tre razze avicole piemontesi. MP presenta un maggior peso vivo e peso della carcassa refrigerata maggiore rispetto a BP e BS (3242 g, 3034 g, 2912 g e 2102 g, 1997 g e 1849 g, rispettivamente). Ciononostante, la resa della carcassa refrigerata è maggiore per BP, rispetto a MP e BS (65,8%, 64,8% e 63,4%). Vi sono differenze significative per quanto riguarda il peso e la resa dei petti: in entrambi i casi, MP presenta risultati maggiori rispetto a BP e BS (346 g, 298 g, 259 g e 16,4%, 14,9% e 13,9%).

La Tabella 1.2 presenta i dati complessivi relativi alla qualità delle uova. Gli aspetti macroscopici delle uova rivelano alcune differenze soprattutto a carico di MP che si discosta da BS e BP per i seguenti parametri: peso dell’uovo, shape index, colore del guscio (per i tre indici L*, a*, b*), mentre per il resto dei parametri le uova risultano simili. Le uniche differenze rilevate fra BS e BP sono: peso uovo, peso guscio, colore guscio (limitatamente a indici L* e a*) e colore tuorlo (limitatamente a indice b*).

La Figura 1.8 rappresenta l’andamento del tasso di ovodeposizione (espresso in percentuale di deposizione giornaliera) e l’evoluzione del peso medio dell’uovo (espresso in g) della gallina BP a partire dalla prima settimana di ovodeposizione, corrispondente alla 21° settimana di vita dell’animale.

La Figura 1.9 rappresenta l’andamento del tasso di ovodeposizione (espresso in percentuale di deposizione giornaliera) e l’evoluzione del peso medio dell’uovo (espresso in g) della gallina BS a partire dalla prima settimana di ovodeposizione della razza più precoce, ovvero BP. L’entrata in deposizione della Bianca di Saluzzo, come si evince dal grafico, corrisponde alla 22° settimana di vita degli animali.

Caratterizzazione genetica delle razze di pollo autoctone attraverso lo studio di polimorfismi in geni candidati coinvolti nella risposta allo stress da calore I dati genomici sono stati riconsegnati dalla ditta LGCgenomics alla nostra unità di ricerca, che ha provveduto ad un’analisi dei dati, rappresentata in Tabella 1. I campioni totali erano 700 e per ognuno di essi sono stati analizzati 21 polimorfismi (SNP) (Tabella 1). Al contrario dell’atteso, solamente uno SNP in analisi è risultato polimorfico: Chen2015_A-69G_hsp70_R. Il seguente SNP si presentava come Omozigote normale (T:T) nel 98,43% degli animali, come Eterozigote (T:A) nel 0,42%, e come Omozigote per il polimorfismo (A:A) nel 1,14%. Gli animali che mostravano un profilo Eterozigote erano tre in totale, appartenenti alle razze Mugellese e Bionda Piemontese. Gli animali che mostravano un profilo Omozigote per il polimorfismo erano 8 in totale ed appartenenti a differenti razze, tra le quali: Livorno, Modenese, Siciliana e Polverara (Figura 3).

Caratterizzazione genetica mediante marcatori microsatelliti La caratterizzazione genetica con marcatori microsatelliti è programmata per fornire strumenti utili alla conservazione di biodiversità in popolazioni nucleo gestite dai PA e nella Criobanca del seme. In particolare, sono considerati i seguenti obiettivi: 1) individuare maschi candidati per la rimonta e la produzione di seme; 2) caratterizzare nuove linee genetiche in razze in conservazione; 3) caratterizzare nuove razze di pollo.

Caratterizzazione di maschi candidati Per la caratterizzazione dei candidati per la produzione di seme sono stati analizzati 20 galli di razza Ermellinata di Rovigo e 16 galli Robusta Lionata. Per la selezione dei capi di rimonta e i piani di accoppiamento sono stati caratterizzati i candidati presenti nei nuclei di conservazione UniMOL, UniFI, UniTO e UniMI. Le razze e il numero di capi genotipizzati sono indicati in Tabella 2.1.

In totale, sono stati analizzati 436 soggetti della specie Gallus gallus presenti nei nuclei di conservazione.

Le analisi successive al controllo della qualità dei dati sono state concluse per tutte le specie previste nel progetto, ovvero Gallus gallus, Anser anser, Numida meleagris e Anas platyrhynchos. Per gli animali appartenenti alle suddette specie/razze sono stati stimati i seguenti indici di diversità genetica: eterozigosità osservata (Ho), eterozigosità attesa (He), frequenza dell’allele minore (MAF) e Runs of Homozygosity (ROH), ossia porzioni di DNA che sono identiche su entrambi i cromosomi all’interno della popolazione e le rispettive isole di appartenenza (Tabella 2).

Scelta dei maschi per la riproduzione e la produzione di materiale seminale I dati di tipizzazione sono stati utilizzati per calcolare la matrice di parentela valutando il numero di alleli condivisi per ciascuna coppia di individui appartenenti alla stessa razza, quindi è stata calcolata la parentela media tra tutti i riproduttori (P) e la parentela media con le linee familiari (Pf).
L’analisi delle componenti principali (PCoA) è stata utilizzata per evidenziare la variabilità genetica esistente nei gruppi campionati. I risultati sono stati rappresentati graficamente (Figura 4.1) in modo da rendere evidenti le differenze genetiche tra i soggetti. Come stima della consanguineità è stata analizzata l’eterozigosi media osservata, insieme al numero di campioni (N), n° alleli diversi (Na), n° alleli effettivo (Ne), Shannon Index (I), eterozigosi effettiva (He) e indice di fissazione (F).

Per i piani di selezione dei maschi, sono stati stimati l’indice di variabilità individuale (H-ind) e la distanza genetica (DPS). Sulla base dei risultati delle analisi riportate precedentemente, per massimizzare la selezione dei maschi, gli indici di variabilità individuale (H-ind) e il grado di parentela (P o Pf) sono stati combinati in un nuovo indice di conservazione (IC) calcolato come la differenza tra H-ind e P/Pf. L’indice varia da 1 a -1, valori elevati indicano bassa consanguineità e maggiore variabilità genetica. Gli indici sono stati utilizzati per la valutazione delle priorità di utilizzo dei singoli soggetti nella fase di riproduzione e per la stima di variabilità genetica presente nei soggetti utilizzati per la produzione di dosi di seme da conservare in Criobanca TuBAvI. I risultati sono descritti in dettaglio nei report di analisi genetica pubblicati nel portale di progetto, alle pagine delle Razze corrispondenti.

Al fine di valutare il miglioramento delle risorse genetiche e dunque monitorare il livello di consanguineità nelle specie Gallus gallus, Anser anser, Numida meleagris e Anas platyrhynchos sono stati stimati indici specifici (FHOM e FROH) per ogni singolo animale, basati sull’eccesso di omozigosi all’interno del genoma delle razze. I risultati, in termini di medie entro razza, sono riportati in Tabella 2. I valori, che possono variare tra 0 e 1, indicano per le razze della specie Gallus gallus, un basso livello di consanguineità e, quindi, un ottimo livello di variabilità genetica. Tuttavia, nelle altre specie/razze, i valori riscontrati suggeriscono un elevato livello di consanguineità, con un conseguente livello di variabilità genetica piuttosto basso.

Biodiversità L’attività svolta ha previsto la caratterizzazione genetica di due nuove popolazioni di pollo, Modenese e Valdarno, e di nuovi individui delle razze Mericanel della Brianza, Livorno e Ancona per l’individuazione di nuove linee di sangue. Il dataset completo è stato utilizzato per calcolare il contributo alla biodiversità mediante la stima delle distanze genetiche con le altre razze avicole già presenti e valutate sia in TuBAvI sia in TuBAvI-2. La matrice delle distanze genetiche calcolate con il metodo di Nei fra tutte le razze analizzate è fornita in Figura 5.1; i valori più bassi evidenziano una distanza genetica minore, quindi similarità fra le popolazioni, mentre i più alti una distanza maggiore. L’analisi delle componenti principali mette in luce le differenze tra le popolazioni, come illustrato in Figura 5.2. La razza Modenese clusterizza con il gruppo delle Livorno (colorazioni varie) e presenta la maggiore distanza genetica dalle razze Robusta lionata, Ermellinata di Rovigo, Siciliana e dal gruppo delle razze settentrionali; mentre la razza Valdarno è più simile alle razze settentrionali, ma anch’essa risulta distante dalle razze Robusta lionata, Ermellinata di Rovigo e Livorno (colorazioni varie).

I dati del progetto TuBAvI-2 per la specie Gallus gallus sono stati uniti a quelli della medesima specie provenienti dal precedente progetto (TuBAvI). Questo ha permesso di stimare la relazione filogenetica sfruttando le distanze genetiche di Reynolds e dipingere un quadro della vicinanza tra le diverse razze appartenenti al patrimonio avicolo locale italiano (Figura 2). Per arricchire ulteriormente l’analisi della biodiversità avicola locale, l’intero dataset delle razze distribuite sul territorio nazionale è stato ampliato con un dataset contenente i genotipi di altre 167 razze provenienti da tutto il mondo. Questo ha permesso di valutare la distanza genetica tra le razze italiane e quelle di altri Paesi a livello globale, oltre a misurare i livelli di biodiversità tra le diverse nazioni. I risultati evidenziano che il patrimonio avicolo locale italiano possiede, complessivamente, un’elevata biodiversità (Figura 3 e Figura 4).

I dati di caratterizzazione genetica, descritti in Azione 2, sono stati completati e organizzati in un dataset utilizzato per calcolare parametri e indici genetici delle razze/popolazioni analizzate. I risultati sono stati confrontati con quelli raccolti nel progetto TuBAvI precedente per la valutazione dell’incremento di consanguineità nel corso delle generazioni. Una sintesi dei risultati è presentata in Tabella 6.1 che confronta i seguenti parametri di valutazione di variabilità genetica: ricchezza allelica (Ne), eterozigosi osservata (Ho), indice di fissazione (F), parentela molecolare (P). I valori calcolati in TuBAvI 2 sono riferiti alle popolazioni genotipizzate nel 2023 e 2024.

Per quanto riguarda le razze in tutela presso UniFI, Mugellese e Valdarnese bianca sono state campionate a fine 2021 e dai campioni raccolti è stato estratto il DNA, sequenziato presso terzi ed elaborato per evidenziare eventuali differenze nel microbiota (Fig. 7.1).
In questa azione, in collaborazione con il PA UniPI, nell’anno 2022 si è svolta la valutazione della resilienza e della resistenza alle patologie e alle sollecitazioni ambientali delle razze Mugellese, Valdarnese bianca, Livorno e Bianca di Saluzzo in termini di benessere animale e resistenza ai patogeni, utilizzando come marker di informazioni la risposta del microbiota intestinale alle sollecitazioni ambientali. I soggetti appartenenti a queste razze sono stati allevati in free-range ed alimentati con il medesimo mangime (Monge) presso la nostra sede UniFI e presso la sede di UniPI, secondo lo stesso schema. A fine prova sono state prelevate da entrambe le sedi le feci ciecali di ciascun soggetto in prova. Dai campioni raccolti è stato estratto il DNA sequenziato presso terzi ed elaborato per evidenziare eventuali differenze nel microbiota (per la razza Bianca di Saluzzo i dati sono riportati in Fig. 7.2).

Nell’anno successivo 2023 si è ripetuto lo stesso disegno sperimentale ma con le razze Pepoi, Robusta lionata, Ermellinata di Rovigo e Ancona. Dai campioni raccolti è stato estratto il DNA sequenziato presso terzi. Sono attesi i risultati del sequenziamento.

Valutazione della resilienza per la crescita alle sollecitazioni ambientali A Settembre 2023 è terminata la prova di crescita delle razze Ermellinata di Rovigo (ER), Ancona (ANC), Pepoi (PP) e Robusta Lionata (RL), iniziata con la schiusa a fine Febbraio e allevate nelle sedi UniPI e UniFI. Pesi e incrementi durante i primi 150 giorni di vita degli animali cresciuti presso UniPI sono riportati nella figura 7.1.1; i dati dei loro consumi e ICA sono in corso di elaborazione; la mortalità totale (1-150 giorni di età) è risultata pari a 68,4%, 38,1%, 27,3% e 25,0% rispettivamente per RL, PP, ER e ANC a causa di una colibacillosi manifestatasi al 14° giorno di vita degli animali. Nella figura 7.1.2. sono mostrati i pesi medi a 120 giorni di età degli animali allevati presso le due sedi.

Raccolta di germoplasma nella Criobanca del Seme delle Razze Avicole Italiane La Criobanca del Seme delle Razze Avicole Italiane è stata ampliata e dosi di seme delle razze descritte in Azione 1 task 1.4 sono state preparate e stoccate in azoto liquido. Il seme è stato congelato utilizzando la procedura descritta per le specie Gallus gallus e Meleagris gallopavo nelle SOP della criobanca. I galli donatori di seme sono stati selezionati nelle popolazioni disponibili in base alla produzione quantitativa e qualitativa di seme. A causa del ridotto volume dell’eiaculato prodotto sia dai galli MO sia dai tacchini BR, le dosi di seme sono state prodotte utilizzando pools di seme per razza. In totale, sono state congelate 149 dosi di seme di razza MO e 26 dosi di seme di razza BR. I tacchini Nero di Italia non hanno prodotto seme e non è stato possibile produrre dosi. Il numero totale di donatori selezionati e di dosi prodotte per razza è indicato in Tabella 8.1. Le dosi di seme sono conservate in azoto liquido in Criobanca.

Alcune dosi di seme sono state scongelate in bagno termostatato a 5°C (SOP Criobanca) per effettuare la valutazione della qualità del materiale seminale dopo congelamento/scongelamento. I valori medi dei parametri di qualità spermatica misurati nel seme crioconservato delle diverse razze sono riportati in Tabella 8.2.

Raccolta di germoplasma nella Criobanca del Seme delle Razze Avicole Italiane Durante il periodo di riferimento è stata ampliata la Criobanca del Seme delle Razze Avicole Italiane con dosi di seme delle razze di tacchino indicate nel task 1.7. Il materiale seminale è stato congelato utilizzando la procedura descritta per la specie Meleagris gallopavo nelle SOP della criobanca. Il numero dei soggetti donatori e delle dosi stoccate per ogni razza è riportato nella tabella 8.1.

Con i genotipi ottenuti dal progetto TuBAvI-2 e dal precedente progetto TuBAvI per la specie Gallus gallus, è stato possibile condurre un’indagine finalizzata all’identificazione di geni coinvolti nella colorazione del guscio delle uova e dei tarsi (Tabella 3).

Con i genotipi degli animali della specie Anas platyrhynchos, appartenenti alle razze Mignon e Germanata Veneta, è stato possibile condurre uno studio di associazione genotipo-fenotipo. Infatti, le due razze all’interno della medesima specie mostrano caratteristiche morfometriche, valutate durante lo svolgimento dell’Azione 1, divergenti. È stato quindi possibile identificare geni candidati associati al diverso sviluppo delle due razze (Tabella 4).